中国医学科学院建立模型，从1000篇我国学者发布的高影响力外文文献、4000篇高影响力中文文献、在我国获批的15万余个药品和8万余个医疗器械、我国学者申请并获授权的22万余个专利的基础数据中，筛出300余项成果。
随后经专家咨询和讨论，由中国医学科学院学部委员评议推选，经中国医学科学院学术咨询执行委员会终评，选出2项重要医学成就。
最终，名列“中国21世纪重要医学成就”的2项医学成就分别是“中国癌症发病与死亡因素分析及早诊早治优化技术方案提升肿瘤防治水平”和“全球首创以EV71型疫苗预防重症手足口病”。
前者通过全面筛查我国肿瘤登记数据，总结了我国人群癌症发病、死亡及生存率等指标，发现了23种可预防的致癌因素，为癌症筛查与诊治提供了标准和指南，显著促进我国癌症筛查及诊治的标准化和均质化。
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后者是我国自主研发的可预防肠道病毒71型(EV71)重症手足口病的疫苗。该疫苗将我国手足口病死亡人数减少了超过90%，而依照该疫苗研发使用制定的《肠道病毒71型(EV71)灭活疫苗的质量、安全性及有效性指导原则》也成了国际标准。
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